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北京大学的农学研究与教育历史悠久。1905年京师大学堂创建农科大学；1910年到1945年，学院经历了晚清、北洋和国民政府三个时期，校名、院名和组织机构也随政局变迁不断演变。1946年10月，北京大学在北平复学，于原北平大学农学院院址重建农学院，并聘请俞大绂教授出任院长。北京大学农学院汇聚了一大批学界才俊，并建立起比较完善的院系体制，此时，北京大学农学院已成为国内规模最大、专业最全、师资力量最雄厚的农学院，为当时全国农业院校之冠。北大农学院在短短几年时间里先后聘请了著名农学家熊大仕、李先闻、李景均、陈华葵、李连捷、蔡旭、吴仲贤等到院任教，共设有农艺学系、园艺学系、森林学系、畜牧学系、兽医学系、农业经济学系、昆虫学系、植物病理学系、农业化学系、土壤肥料科学系10个系，全院教员120多人，学生规模达300多人。 1949年，北京大学农学院、清华大学农学院与华北大学农学院合并组建北京农业大学，但北京大学对于农学的研究始终弦歌未绝，应用化学、生物技术与应用微生物、毒物学、医药化学、教育科学、老年病学等领域均进行了大量的农学边缘学科、农学核心学科领域研究。 随着我国社会、经济的进一步发展，现代农业科学的重要性愈加凸显。加快发展现代农业，既是转变经济发展方式、全面建设小康社会的重要内容，也是提高农业综合生产能力、增加农民收入、建设社会主义新农村的必然要求。党的“十八大”报告提出“四化同步”，明确指出“坚持走中国特色新型工业化、信息化、城镇化、农业现代化道路，推动信息化和工业化深度融合、工业化和城镇化良性互动、城镇化和农业现代化相互协调，促进工业化、信息化、城镇化、农业现代化同步发展”。 在此背景下，为适应我国发展现代农业的需要，将国家重大需求与北京大学的学科优势相结合，开展高起点、高标准、国际一流的前沿农业研究和人才培养，北京大学2014年10月决定成立北京大学现代农学院（筹），并于2017年12月13日去筹正式成立了北京大学现代农学院。 北京大学现代农学院为北京大学独立建制的教学科研实体单位。 立足于将国家重大需求与北大综合学科优势相结合， 开展高起点、高标准、国际一流的前沿农业科学研究和人才培养。重点发展农业生物技术、农业与发展经济， 食物安全与健康、智慧农业交叉学科研究与人才培养， 着力解决现代农业产业发展中面临的重大科学问题和瓶颈问题， 建设集基础理论、产业应用、战略政策为一体的高端人才培养基地， 为国家新农村发展提供基础理论支撑、核心技术支撑、骨干人才支撑和政策咨询支撑。