广州医科大学是国家“双一流”建设高校，拥有1个国家医学中心、1个国家临床医学研究中心、1个国家重点实验室、12个省部级重点实验室、5个省部级工程技术研究中心/工程实验室、1个省部共建协同创新中心和1个国家大学科技园培育基地等平台。学校拥有1个国家重点学科、7个省部级重点学科、33个市（厅）级重点学科。其中，临床医学入选国家“双一流”建设学科，进入ESI全球前1‰。另有精神病与精神卫生学（全国第六，华南第一；广州医科大学附属脑科医院为教学医院）、神经科学与行为学、生物学与生物化学和分子生物学与遗传学等10个学科进入ESI排名全球前1%。