上海交通大学医学院分子医学研究院新建于2017年10月，由中国科学院院士谭蔚泓教授领衔建立，并依托上海交通大学医学院附属仁济医院实体建设。研究院聚焦分子医学前沿，立足于重大疾病创新药物研发与早诊确诊防控技术的突破，从基础前沿研究到知识产权和产业化落地，全程助推健康中国建设。研究院建有上海市核酸化学与纳米医学重点实验室平台，并集聚多名中国科学院院士、国家杰青、国家优青、青年长江学者、国家及上海市高层次引进计划获得者等高水平中青年专家。研究院已经成为学科交叉特色鲜明的教学、科研、产业化人才“摇篮”。 研究院青年人才聚集，提倡自由学术探索，以学术兴趣和创新潜力为动力，积极鼓励跨学科合作与创新。经团队共同建设，研究院已形成“仁爱互助”、“快乐科研”、“争锋前沿”的文化氛围。目前，设立有核酸化学研究组、分子自组装与分子网络研究组、体外检测与诊断研究组、分子和纳米药物的临床转化等课题组。众多相关成果在Nature、science和Nature 系列等国际知名杂志上发表。近5年团队成员承担有国家重大科学研究计划、科技部重大专项、科技部重大仪器专项、国家杰青、优青基金等多项国家和省部级项目。2019年底，经上海市科委审批研究院正式启动“上海市核酸化学与纳米医学重点实验室”的建设工作。 研究院的实验平台布局合理，技术力量雄厚，仪器设备先进。配备有共聚焦扫描显微镜、轨道阱质谱仪、核磁共振仪、透射电镜、原子力显微镜、紫外光刻系统等多台大型精密仪器。 建院以来，研究院致力完善从基础研究到应用开发的完整创新成果产出。已与上海市三级甲等医疗单位开展临床合作研究，实现了基础研究和临床应用的紧密结合。