温州医科大学附属第二医院骨科入选国家重点专科建设项目、浙江省高校一流学科、浙江省高校重中之重学科、浙江省医学重点学科、浙江省医学创新学科、浙江省医学支撑学科、浙江省骨科重点实验室、浙江省工程研究中心、浙江省国际联合实验室、浙江省脊柱外科中心、浙江省儿童青少年脊柱健康指导中心，温州医科大学骨科研究所、温州医科大学骨科生物技术应用研究所、温州医科大学骨科数字化研究所、全国微创脊柱外科技术培训基地、中国修复重建外科显微外科培训继续教育基地、HVO（北美海外健康志愿者协会）中国基地、中国医师协会创面修复专科建设培育单位、301环骨盆微创救治联盟常务理事单位、国际UBE协会浙江UBE联盟常务理事单位、中国糖尿病足联盟中心建设单位、浙江省骨科学重点实验室-国际华人骨研学会联合研究中心、 国家骨科与运动康复临床医学研究中心（骨科微创技术温州分会中心）、张英泽院士工作站、国家药物和医疗器械临床试验备案专业、住院医师规范化培训基地和温州医科大学硕、博士授予点。本学科在2023年度中国医院科技量值（STEM）全国排名第13名，浙江省第1名。 2009年正式成立骨科医院，是国内规模大、分科齐全、综合实力强的骨科临床中心之一。目前设有14个普通病区，1个日间病区，2个ICU病区，约800多张床位，附设2个研究所,1个重点实验室。设脊柱外科、手显微外科、创伤骨科、骨病与关节外科、儿童骨科、创面外科、运动医学科足踝外科等八大专科20个亚专业，年门急诊超40万人次，年手术患者近4万人次，居国内第一方阵。