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 中国水稻研究所是一个以水稻为主要研究对象的多学科综合性国家级研究所。1981年6月经国务院批准在杭州建立，1989年10月落成，是建国以来我国一次性投资最大的农业科研机构。现隶属于中国农业科学院和浙江省人民政府双重领导。2002年经科技部等部门批准为非营利性农业科研机构。现任所长为胡培松院士。 研究所以应用基础研究和应用研究为主，着重解决稻作生产中的重大科技问题。具有从事水稻群体、个体、组织、细胞、分子等各层次的科研能力。研究所主要从事应用基础研究和应用研究。主要任务是： （一）水稻种质资源的收集、保存、评价和种质创新与利用； （二）水稻重要基因的挖掘利用； （三）水稻育种新技术创新与新品种选育； （四）水稻栽培与耕作研究； （五）水稻生产突发问题应急攻关； （六）水稻品质安全与决策咨询服务。 现内部科研机构设有：国家水稻改良中心、稻作技术研究与发展中心、农业部稻米及制品质量检验测试中心、科技信息中心、北方水稻研究中心和水稻生物育种全国重点实验室，简称为“五个中心、一个实验室”。 研究所现有工作人员500余人，其中，中国工程院、中国科学院院士各1人，中高级科技人员231人，博士生导师37人，具有博士学位160人，硕士学位51人。同时还聘请国内外著名科学家担任兼职研究员。 研究所位于杭州市，拥有一个包括实验室群、试验农场等在内的科学实验基地，占地 5300 余亩。建有科学实验楼、图书信息楼、生物工程楼、水稻种质库、人工气候箱群、温室、访问科学家与进修培训人员宿舍及其他配套设施，总建筑面积 11 万平方米。实验室中配备有近 3亿元的仪器设备。在海南陵水县建有海南试验中心。在黑龙江宝清县建有北方水稻研究中心。 研究所遵循 " 立足浙江、面向全国、放眼世界 " 的办所方针，积极承担来自国家、农业农村部、浙江省、中国农业科学院和国际合作等立项渠道的科研任务。至 2023 年12月，研究所共取得省部级以上获奖成果 151项次，国家级获奖成果 25 项，涵盖了国家自然科学奖、国家技术发明奖、国家科学技术进步奖三大奖项。2018年3月发布的基本科学指标数据库（ESI）数据显示，研究所在“植物学与动物学”领域跻身ESI全球前 1% 行列。1997 年、1998 年、2000 年、2003 年、2010 年和2016年分别有成果入选中国十大科技进展和中国十大科技新闻。成果年应用面积在1.5 亿亩以上，取得了巨大的社会经济效益。“十五”期间研究所获得全国农业科研机构综合科研能力评估第一名。 目前研究所按照“四个面向”“三个着力”的总要求，为早日实现“世界一流学科”“世界一流研究所”砥砺前行。