单位: 上海交通大学医学院 / 上海市免疫学研究所
研究方向:基因组学 × 肿瘤免疫 × 单细胞组学 × 机器学习 × 转化医学
职位简介:
张文翔研究组致力于探索适应性免疫系统的基因转录调控机制及其临床转化应用,现因团队发展需要,招聘生物信息学工程师1–2名,协助处理多组学数据、开发分析流程并参与课题推进。
工作内容:
1. 参与单细胞转录组、ATAC-seq、ChIP-seq、RNA-seq、WGS/WES、代谢组、三维空间基因组等多组学数据的处理与整合;
2. 开发或优化生物信息分析流程(pipeline),包括数据清洗、可视化、统计建模等;
3. 协助课题组成员进行数据挖掘、机制推断、结果展示与文章图表制作;
4. 参与组内多学科研究与分析设计,推动基础研究与临床样本数据的结合。
岗位要求:
1. 硕士及以上学历,生物信息学、计算生物学、生物统计学、计算机科学等相关专业;
2. 熟悉R、Python、Shell等编程语言,具备Linux操作系统下独立进行数据分析的能力;
3. 具有单细胞/空间组学/转录组/表观组学等任一领域的实际分析经验者优先;
4. 做事认真细致,具备良好的沟通协作能力与科研责任感;
5. 欢迎具备交叉背景(如“干湿结合”)或有志于科研转化者加入。
岗位待遇:
1.薪资待遇根据工作经验和能力面议,提供五险一金;
2.优秀者支持转岗攻读博士或出国交流等机会;
3.提供良好的工作氛围、一流科研平台与交叉合作机会;
4.工作表现优异者有机会参与课题核心科研任务与作者署名。
课题组简介:
课题组聚焦基因转录调控机制在免疫系统中的作用与转化潜力,结合分子生物学、生物信息学、结构生物学与单细胞/空间多组学等多学科手段,探索适应性免疫转录调控机制,以及调节性T细胞(Treg)在肿瘤及自身免疫中的关键功能机制。在基础研究的同时紧密结合临床实践,与瑞金医院等合作并探索临床转化。致力于在解决科学问题的同时,满足临床需求,期望能够研发出原创性药物,惠及广大患者。课题组长在生物医药研发、风险投资、创业以及科研方面,拥有丰富的经验,力求在生物医药领域取得突破性的成果,为人类的健康事业贡献力量。研究方向包括:适应性免疫转录调控机制、Treg细胞功能可塑性、肿瘤免疫微环境与精准医学、端粒的转录调控机制等。
近年来在FOXP3功能机制与免疫调控网络构建方面取得系列突破性成果,相关研究发表于 Nature(2023)、Immunity(2022,封面)等国际顶尖期刊,担任Nature Immunology,Frontiers in Immunology等期刊的审稿人。主持海外优青、国自然、上海市科委、上海市卫健委等项目;并获Jeffery Modell奖、哈佛杰出华人生命科学研究奖、余㵑学者、小米青年学者、福布斯中国·青年海归菁英、上海浦江人才、上海海外高层次人才等。