生物医学人工智能实验室简介:
生物医学人工智能实验室聚焦于人工智能与生物医学交叉研究,团队成员来自计算机、数学、生物、物理等不同学科背景。实验室基于多模态生物医学大数据,面向健康风险预测、智能诊疗及干预、预后评估等发展和应用人工智能算法理论与技术。近年来,围绕生物医学大数据的特点,发展了一系列人工智能算法,已成功应用于脑-肠轴、脑发育和脑疾病等场景中,相关工作发表于Nature、Science、Cell、Cell Metabolism、IEEE TPAMI、Molecular Psychiatry、Nature Communications等期刊,曾获吴文俊人工智能自然科学一等奖和教育部自然科学二等奖,承担了国家杰出青年基金、国家重点研发计划、国家自然科学基金重点项目和面上项目、上海市重大科技专项子课题等项目。
研究方向:
1.影像遗传学
基于自产和国内外主流公共数据平台的长短读基因组、代谢组、蛋白组、行为量表数据,依托张江国际脑库采集与收录的海量磁共振脑影像数据:
(1)开发算法识别影像-遗传多模态脑疾病早期诊疗标记物、鉴定中国人群遗传风险特征;
(2)探究脑疾病的遗传共性及其与衰老的关联;
(3)发展基于AI的医学影像诊断模型、多模态新型治疗干预方法等。
2.单细胞与空间组学
致力于开发面向单细胞与空间组学数据的新型算法:
(1)开发基于AI的单细胞空间组学数据整合挖掘算法,揭示跨尺度多维度分子信息;
(2)构建脑组织的细胞时空图谱,精准鉴定细胞亚型,重构细胞间相互作用,解析细胞亚群在脑发育和脑疾病中的作用和机制;
(3)与合作者发展单细胞空间组学测序新技术,推动神经科学研究和精准医疗的发展。
3.计算微生物组学
依托自产和公共数据平台的海量微生物基因组、代谢组等数据:
(1)研发长短读段测序数据、多组学数据融合的宏基因组数据组装分析流程与新型算法;
(2)识别微生物物种、鉴定新基因、新蛋白;
(3)研发病毒-细菌相互作用预测方法;
(4)开展微生物多组学与宿主疾病/行为/基因组关联分析及疾病分型等研究。
岗位职责:
1.负责医学影像系统及平台系统研发;
2.遵从架构设计、数据设计,按照系统定义,实现系统的高扩展性、高性能;
3.参与后端业务的工程化、流程化推进;
4.完成所负责模块的单元测试,保障代码正确,性能达标,符合设计要求;
5.技术预研和重点技术攻关,保障系统可用性、稳定性、和扩展性;
6.撰写接口文档和其他设计交付文档,定期汇总和分享技术成果,对系统优化提出建议。
应聘条件:
1.拥护党和国家的各项方针政策,遵守法律法规,品行端正;身体健康,心理素质良好;爱岗敬业,恪守学术规范和职业道德;
2.具有计算机、软件工程、数学及相关专业硕士及以上学历,5年以上相关工作经验;
3.年龄一般在35周岁以下;
4.具有中级专业技术职务任职资格;
5.熟悉至少Python/Golang/C++等一种编程语言,负责业务后端服务的设计、研发,保证后端服务稳定性;对后端性能优化有丰富经验,对高并发、高可用架构系统有深刻理解;熟悉HTTP、TCP/IP等常见网络协议,理解并掌握RESTful风格接口设计;熟悉至少PostgreSQL、MySQL等一种数据库,有性能调优相关经验;熟悉至少MongoDB、Redis等一种NoSQL数据库;有良好代码书写、注释和单元测试习惯;
6.具备软件部署、优化经验,有Docker使用经验;
7.具备良好的团队合作精神,有强烈的责任心和积极主动的工作态度,较强的沟通能力和表达能力。
应聘材料:
个人简历、代表性论文。
我们将致力于提供优越的学术研究平台、充足的自主探索空间和长期的职业发展支持,诚邀有志于学术研究的青年才俊加入!