生物医学人工智能实验室简介:
生物医学人工智能实验室聚焦于人工智能与生物医学交叉研究,团队成员来自计算机、数学、生物、物理等不同学科背景。实验室基于多模态生物医学大数据,面向健康风险预测、智能诊疗及干预、预后评估等发展和应用人工智能算法理论与技术。近年来,围绕生物医学大数据的特点,发展了一系列人工智能算法,已成功应用于脑-肠轴、脑发育和脑疾病等场景中,相关工作发表于Nature、Science、Cell、Cell Metabolism、IEEE TPAMI、Molecular Psychiatry、Nature Communications等期刊,曾获吴文俊人工智能自然科学一等奖和教育部自然科学二等奖,承担了国家杰出青年基金、国家重点研发计划、国家自然科学基金重点项目和面上项目、上海市重大科技专项子课题等项目。
研究方向:
1.影像遗传学
基于自产和国内外主流公共数据平台的长短读基因组、代谢组、蛋白组、行为量表数据,依托张江国际脑库采集与收录的海量磁共振脑影像数据:
(1)开发算法识别影像-遗传多模态脑疾病早期诊疗标记物、鉴定中国人群遗传风险特征;
(2)探究脑疾病的遗传共性及其与衰老的关联;
(3)发展基于AI的医学影像诊断模型、多模态新型治疗干预方法等。
2.单细胞与空间组学
致力于开发面向单细胞与空间组学数据的新型算法:
(1)开发基于AI的单细胞空间组学数据整合挖掘算法,揭示跨尺度多维度分子信息;
(2)构建脑组织的细胞时空图谱,精准鉴定细胞亚型,重构细胞间相互作用,解析细胞亚群在脑发育和脑疾病中的作用和机制;
(3)与合作者发展单细胞空间组学测序新技术,推动神经科学研究和精准医疗的发展。
3.计算微生物组学
依托自产和公共数据平台的海量微生物基因组、代谢组等数据:
(1)研发长短读段测序数据、多组学数据融合的宏基因组数据组装分析流程与新型算法;
(2)识别微生物物种、鉴定新基因、新蛋白;
(3)研发病毒-细菌相互作用预测方法;
(4)开展微生物多组学与宿主疾病/行为/基因组关联分析及疾病分型等研究。
岗位职责:
1.利用生物信息学方法从事脑重大疾病的多组学数据分析;
2.独立承担或协助完成研究组组长交给的研究课题;
3.参与科研基金申请和协助研究组组长制定课题计划及撰写研究论文。
应聘条件:
1.在海内外高水平大学即将获得博士学位,或获得博士学位一般不超过3年的优秀博士/博士生,生物信息学、医学影像学、计算机科学等专业,科研成果突出;
2.品学兼优、身心健康;年龄一般不超过 35 岁;
3.熟悉Unix/Linux操作系统,熟练使用R、Perl、Python 等语言中的一种。具有高通量多组学数据(Post-GWAS、genome sequencing 、eQTLs、RNA-Seq等)分析经验;
4.具有较强的团队合作精神,进站研究计划需与合作导师的科研课题或者研究专长相关;具有较高科研热情、较强英文读写与交流的能力。
薪酬待遇:
1.参照复旦大学相关标准提供具有国际竞争力的薪资待遇;
2.支持申请各种基金项目:包括中国博士后基金、国家自然科学基金、上海扬帆计划、上海市和复旦大学超博基金等;
3.提供优良的办公环境及国际一流的研究平台;协助申请教师/博士后公寓(已婚可申请两室一厅);按照复旦大学相关政策,协助子女申请复旦大学附属幼儿园和小学入学资格。
应聘材料:
个人简历、代表性论文。
我们将致力于提供优越的学术研究平台、充足的自主探索空间和长期的职业发展支持,诚邀有志于学术研究的青年才俊加入!